Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms