Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3BQ9UBC3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3BQ9UBC3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms