Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-18Q9QC07 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms