Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
REREQ9P2R6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
REREQ9P2R6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
REREQ9P2R6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
REREQ9P2R6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms