Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF9Q9P2J2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF9Q9P2J2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms