Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM9Q9NXL9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM9Q9NXL9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms