Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGEF38Q9NXL2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF38Q9NXL2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms