Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM260Q9NX78 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM260Q9NX78 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms