Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP5S1Q9NUS5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP5S1Q9NUS5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms