Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCOLN1Q9GZU1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCOLN1Q9GZU1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCOLN1Q9GZU1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCOLN1Q9GZU1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCOLN1Q9GZU1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCOLN1Q9GZU1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCOLN1Q9GZU1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MCOLN1Q9GZU1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCOLN1Q9GZU1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCOLN1Q9GZU1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MCOLN1Q9GZU1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MCOLN1Q9GZU1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MCOLN1Q9GZU1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MCOLN1Q9GZU1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms