Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDRD1Q9BXT4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD1Q9BXT4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms