Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM1Q9BR11 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms