Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
LTV1Q96GA3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LTV1Q96GA3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LTV1Q96GA3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms