Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx4Q91YJ2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx4Q91YJ2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx4Q91YJ2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx4Q91YJ2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx4Q91YJ2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx4Q91YJ2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx4Q91YJ2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx4Q91YJ2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms