Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBS3

SLC4A11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A11Q8NBS3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A11Q8NBS3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A11Q8NBS3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A11Q8NBS3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A11Q8NBS3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A11Q8NBS3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A11Q8NBS3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A11Q8NBS3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A11Q8NBS3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC4A11Q8NBS3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A11Q8NBS3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms