Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC4Q8N9L1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms