Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC43Q8N309 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms