Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUX4L9Q6RFH8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUX4L9Q6RFH8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms