Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO4Q6EEV6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.5 ms