Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC44A4Q53GD3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC44A4Q53GD3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC44A4Q53GD3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms