Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
FOXD1Q16676 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
FOXD1Q16676 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
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