Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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