Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNA6Q15825 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA6Q15825 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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