Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
R3HDM1Q15032 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
R3HDM1Q15032 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
R3HDM1Q15032 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
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