Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNDQ07001 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms