Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms