Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TFF2Q03403 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms