Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms