Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gnb1P62874 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gnb1P62874 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms