Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB38P57729 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB38P57729 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB38P57729 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB38P57729 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB38P57729 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB38P57729 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB38P57729 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB38P57729 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB38P57729 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB38P57729 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB38P57729 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB38P57729 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB38P57729 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB38P57729 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB38P57729 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB38P57729 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB38P57729 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB38P57729 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB38P57729 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB38P57729 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB38P57729 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB38P57729 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB38P57729 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB38P57729 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB38P57729 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB38P57729 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB38P57729 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB38P57729 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB38P57729 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB38P57729 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB38P57729 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB38P57729 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB38P57729 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB38P57729 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB38P57729 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB38P57729 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB38P57729 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB38P57729 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB38P57729 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB38P57729 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB38P57729 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB38P57729 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB38P57729 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB38P57729 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB38P57729 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB38P57729 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB38P57729 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB38P57729 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB38P57729 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB38P57729 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB38P57729 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB38P57729 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB38P57729 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB38P57729 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB38P57729 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB38P57729 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB38P57729 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB38P57729 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB38P57729 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB38P57729 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB38P57729 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB38P57729 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB38P57729 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB38P57729 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB38P57729 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB38P57729 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB38P57729 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB38P57729 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB38P57729 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB38P57729 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB38P57729 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB38P57729 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB38P57729 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB38P57729 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB38P57729 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB38P57729 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB38P57729 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB38P57729 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB38P57729 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB38P57729 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB38P57729 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB38P57729 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB38P57729 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB38P57729 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB38P57729 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB38P57729 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB38P57729 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB38P57729 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB38P57729 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB38P57729 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB38P57729 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB38P57729 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB38P57729 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB38P57729 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB38P57729 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB38P57729 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB38P57729 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB38P57729 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB38P57729 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms