Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST2P52849 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST2P52849 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST2P52849 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST2P52849 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST2P52849 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST2P52849 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST2P52849 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST2P52849 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST2P52849 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST2P52849 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST2P52849 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST2P52849 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST2P52849 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST2P52849 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST2P52849 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST2P52849 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST2P52849 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST2P52849 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST2P52849 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST2P52849 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST2P52849 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST2P52849 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST2P52849 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST2P52849 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST2P52849 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST2P52849 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST2P52849 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST2P52849 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST2P52849 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST2P52849 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST2P52849 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST2P52849 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST2P52849 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST2P52849 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST2P52849 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST2P52849 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST2P52849 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST2P52849 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST2P52849 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST2P52849 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST2P52849 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST2P52849 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST2P52849 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDST2P52849 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST2P52849 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST2P52849 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST2P52849 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST2P52849 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST2P52849 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST2P52849 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST2P52849 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST2P52849 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST2P52849 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDST2P52849 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDST2P52849 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDST2P52849 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDST2P52849 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDST2P52849 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST2P52849 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST2P52849 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST2P52849 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST2P52849 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST2P52849 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST2P52849 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST2P52849 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST2P52849 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST2P52849 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST2P52849 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST2P52849 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST2P52849 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDST2P52849 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST2P52849 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST2P52849 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST2P52849 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST2P52849 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST2P52849 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST2P52849 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST2P52849 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST2P52849 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDST2P52849 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST2P52849 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST2P52849 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST2P52849 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST2P52849 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDST2P52849 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST2P52849 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST2P52849 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST2P52849 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST2P52849 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST2P52849 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST2P52849 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST2P52849 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST2P52849 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST2P52849 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST2P52849 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST2P52849 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST2P52849 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST2P52849 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST2P52849 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms