Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA3P51805 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA3P51805 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms