Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLCSP50747 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLCSP50747 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLCSP50747 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLCSP50747 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLCSP50747 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLCSP50747 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HLCSP50747 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLCSP50747 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLCSP50747 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLCSP50747 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLCSP50747 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLCSP50747 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLCSP50747 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLCSP50747 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLCSP50747 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLCSP50747 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HLCSP50747 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLCSP50747 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HLCSP50747 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HLCSP50747 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLCSP50747 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLCSP50747 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLCSP50747 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLCSP50747 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLCSP50747 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLCSP50747 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLCSP50747 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLCSP50747 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLCSP50747 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLCSP50747 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLCSP50747 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLCSP50747 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLCSP50747 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLCSP50747 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLCSP50747 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLCSP50747 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLCSP50747 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLCSP50747 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLCSP50747 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLCSP50747 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLCSP50747 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLCSP50747 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLCSP50747 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLCSP50747 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLCSP50747 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HLCSP50747 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLCSP50747 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLCSP50747 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLCSP50747 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLCSP50747 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLCSP50747 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLCSP50747 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLCSP50747 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLCSP50747 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLCSP50747 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLCSP50747 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLCSP50747 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLCSP50747 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLCSP50747 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLCSP50747 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLCSP50747 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLCSP50747 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HLCSP50747 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLCSP50747 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLCSP50747 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HLCSP50747 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLCSP50747 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLCSP50747 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLCSP50747 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLCSP50747 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLCSP50747 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLCSP50747 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLCSP50747 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLCSP50747 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLCSP50747 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLCSP50747 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLCSP50747 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLCSP50747 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLCSP50747 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLCSP50747 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLCSP50747 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLCSP50747 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLCSP50747 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLCSP50747 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLCSP50747 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLCSP50747 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLCSP50747 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HLCSP50747 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLCSP50747 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLCSP50747 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLCSP50747 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLCSP50747 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLCSP50747 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLCSP50747 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLCSP50747 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLCSP50747 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLCSP50747 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLCSP50747 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLCSP50747 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 443.6 ms