Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LMOD1P29536 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMOD1P29536 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms