Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA5P22460 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNA5P22460 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA5P22460 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms