Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MYCNP04198 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MYCNP04198 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYCNP04198 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYCNP04198 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYCNP04198 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYCNP04198 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYCNP04198 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYCNP04198 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MYCNP04198 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYCNP04198 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYCNP04198 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYCNP04198 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYCNP04198 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYCNP04198 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYCNP04198 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MYCNP04198 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYCNP04198 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYCNP04198 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYCNP04198 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYCNP04198 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYCNP04198 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYCNP04198 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYCNP04198 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYCNP04198 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYCNP04198 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYCNP04198 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYCNP04198 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYCNP04198 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYCNP04198 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYCNP04198 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MYCNP04198 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYCNP04198 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYCNP04198 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MYCNP04198 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYCNP04198 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYCNP04198 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYCNP04198 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYCNP04198 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYCNP04198 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYCNP04198 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYCNP04198 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYCNP04198 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYCNP04198 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYCNP04198 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYCNP04198 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MYCNP04198 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYCNP04198 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYCNP04198 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYCNP04198 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYCNP04198 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MYCNP04198 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYCNP04198 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MYCNP04198 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYCNP04198 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYCNP04198 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYCNP04198 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYCNP04198 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYCNP04198 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYCNP04198 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYCNP04198 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MYCNP04198 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MYCNP04198 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYCNP04198 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYCNP04198 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYCNP04198 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYCNP04198 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYCNP04198 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MYCNP04198 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYCNP04198 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYCNP04198 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MYCNP04198 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYCNP04198 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYCNP04198 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYCNP04198 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYCNP04198 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYCNP04198 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYCNP04198 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYCNP04198 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYCNP04198 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYCNP04198 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYCNP04198 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYCNP04198 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYCNP04198 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYCNP04198 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYCNP04198 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYCNP04198 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYCNP04198 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYCNP04198 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYCNP04198 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYCNP04198 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYCNP04198 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYCNP04198 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYCNP04198 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYCNP04198 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MYCNP04198 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MYCNP04198 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYCNP04198 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYCNP04198 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYCNP04198 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms