Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA2O43921 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA2O43921 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms