Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3O43889 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3O43889 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3O43889 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3O43889 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3O43889 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3O43889 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3O43889 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3O43889 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3O43889 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3O43889 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3O43889 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3O43889 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3O43889 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3O43889 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3O43889 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3O43889 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3O43889 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3O43889 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3O43889 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3O43889 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREB3O43889 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREB3O43889 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREB3O43889 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREB3O43889 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREB3O43889 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3O43889 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3O43889 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3O43889 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3O43889 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3O43889 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3O43889 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3O43889 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3O43889 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3O43889 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3O43889 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3O43889 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3O43889 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3O43889 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3O43889 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3O43889 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3O43889 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3O43889 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3O43889 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3O43889 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3O43889 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3O43889 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3O43889 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3O43889 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3O43889 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3O43889 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3O43889 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3O43889 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3O43889 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3O43889 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3O43889 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3O43889 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3O43889 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3O43889 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3O43889 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3O43889 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3O43889 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3O43889 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3O43889 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3O43889 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3O43889 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3O43889 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3O43889 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3O43889 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3O43889 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3O43889 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3O43889 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3O43889 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3O43889 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3O43889 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3O43889 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3O43889 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3O43889 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3O43889 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3O43889 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3O43889 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3O43889 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms