Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms