Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRBA1A5PL33 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms