Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LYSTQ99698 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms