Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALPK3Q96L96 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms