Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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