Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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