Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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