Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDB1Q16531 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms