Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms