Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms