Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC245517.1-201ENST00000444224 1262 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC114928.1-201ENST00000446516 415 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL133415.1-201ENST00000456355 706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC112484.4-201ENST00000567253 811 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC024475.3-205ENST00000634991 481 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 LINC00538-201ENST00000626109 1906 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL031009.1-201ENST00000624137 2182 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL078590.2-201ENST00000417483 1360 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 RTN3-204ENST00000354497 1407 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC105053.1-201ENST00000366278 1711 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SET-205ENST00000409104 962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms