Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXD4P09016 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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